Родился 19 февраля 1976 года в городе Тюмени. Окончил среднюю школу.
В Вооруженных Силах с августа 1993 года. Поступил в Рязанское высшее военное воздушно-десантное командное училище, но затем был переведен на разведывательный факультет Новосибирского военного общевойскового командного училища, которое окончил в 1997 году. Служил в 12-й отдельной бригаде специального назначения ГРУ ГШ в составе Уральского военного округа (бригада дислоцируется в городе Асбест Свердловской области).
В августе 1999 года командир разведроты бригады Сергей Уженцев вместе со своим подразделением прибыл в командировку в Ботлихский район Дагестана.
Отличился в боевых действиях против бандформирований чеченских и международных террористов, вторгшихся из Чечни. В ходе одной из операций капитаном Уженцевым была «вычислена» машина с вооруженными террористами. При попытке задержания сидевшие в машине бандиты открыли огонь и были уничтожены в результате грамотных действий командира, без погибших и раненых с нашей стороны.
В сентябре 1999 года при разведвыходе по тылам боевиков один из бойцов задел установленную боевиками растяжку, прикрепленную к гранате. Услышав щелчок от выдернутой чеки, Уженцев мгновенно подал команду «Ложись!» и закрыл своим телом майора – командира разведгруппы. При взрыве гранаты получил около десяти осколочных ранений, но командир и остальные бойцы не пострадали.
За мужество и героизм, проявленные в контртеррористической операции на Северном Кавказе, Указом Президента Российской Федерации от 24 октября 2000 году капитану Уженцеву Сергею Викторовичу присвоено звание Героя Российской Федерации.
Герой России Уженцев продолжает службу в Вооруженных Силах РФ, был заместителем командира парашютно-десантного батальона по воздушно-десантной подготовке. В настоящее время – старший помощник начальника оперативно-разведывательного отдела одной из бригад специального назначения ГРУ ГШ, ему присвоено воинское звание «майор».
Награжден медалью «За отвагу» (1999).
В честь Героя России Сергея Викторовича Уженцева на мемориале Героев-выпусников Новосибирского военного общевойскового командного училища установлен его бюст [35, 40, 394, 443, 7878].